世界贸易组织共设立了以下几个机构：
　　（一）部长会议，由所有成员方的代表组成，是世界贸易组织的最高决策机构，它负责履行世界贸易组织的各项职能，并为此采取必要的行动。部长会议有权对有关多边贸易协议的事项作出决定。部长会议至少每两年召开一次会议。
　　（二）总理事会，也由各成员方代表组成，是世界贸易组织的常设决策机构，在部长会议休会期间执行部长会议的各项职能。总理事会下设3个专门理事会，即“货物贸易理事会”、“服务贸易理事会”和“与贸易有关的知识产权理事”。
　　（三）部长会议下设的专门委员会：
　　1. 贸易与发展委员会，负责与发展中国家特别是最不发达国家有关的事务；
　　2. 国际收支限制委员会，负责在一成员方根据《1994关贸总协定》第12条和第18条为解决其收支平衡困难而采取贸易限制措施时，协调该成员方与其他成员方之间的关系；
　　3. 预算、财务与行政管理委员会，负责世界贸易组织财政和预算方面的事务。
　　上述各委员的成员从所有成员的代表中产生。
　　（四）秘书处，是世界贸易组织的日常办事机构，由总干事领导。总干事的人选由部长会议任命，其权力、职责、服务条件和任期也由部长会议决定。